โครงการฉลากเขียวมีคณะกรรมการและคณะทำงานซึ่งมีหน้าที่และความรับผิดชอบแตกต่างกัน เพื่อให้การดำเนินงานในแต่ละขั้นตอนของโครงการเป็นไปอย่างบริสุทธิ์ ยุติธรรมและโปร่งใส ดังต่อไปนี้
คณะกรรมการฯ จะแต่งตั้งคณะกรรมการเพื่อช่วยสนับสนุนงานหรือกิจการของคณะกรรมการฯ และโครงการฉลากเขียว โดยแบ่งเป็นคณะกรรมการเทคนิค คณะกรรมการทบทวนร่างข้อกำหนด และคณะอนุกรรมการเฉพาะกิจอื่น ๆ
คณะอนุกรรมการเทคนิค
คณะกรรมการเทคนิคมีฐานะเป็นคณะกรรมการกิตติมศักดิ์ ทำหน้าที่จัดทำร่างข้อกำหนดสำหรับผลิตภัณฑ์แต่ละประเภท ที่ผ่านการคัดเลือกจากคณะกรรมการฯ แล้ว กำหนดวิธีทดสอบมาตรฐานของผลิตภัณฑ์ด้านคุณภาพและสิ่งแวดล้อม พร้อมทั้งจัดทำรายงานเสนอความสำคัญ ประโยชน์ของผลิตภัณฑ์ และผลกระทบของผลิตภัณฑ์ต่อสิ่งแวดล้อมที่น้อยลง ประเมินปริมาณการซื้อขายและรายได้จากการขายผลิตภัณฑ์นั้นในตลาด ตลอดจนดำเนินการวิชาการอื่น ๆ ที่เกี่ยวข้อง
คณะกรรมการเทคนิคแบ่งเป็นหลายคณะตามประเภทของผลิตภัณฑ์ ประกอบด้วยฝ่ายเลขานุการโครงการผู้เชี่ยวชาญจากหน่วยงานต่าง ๆ กลุ่มอุตสาหกรรมผู้ผลิต และนักวิชาการสิ่งแวดล้อม ซึ่งจะได้รับการแต่งตั้งตามความชำนาญในผลิตภัณฑ์แต่ละประเภท
ฝ่ายเลขานุการจะเป็นผู้เรียกประชุมและช่วยจัดเตรียมข้อมูลของผลิตภัณฑ์เสนอต่อที่ประชุม
คณะอนุกรรมการทบทวนร่างข้อกำหนด
คณะอนุกรรมการทบทวนร่างข้อกำหนดมีฐานะเป็นคณะกรรมการกิตติมศักดิ์ และได้รับการแต่งตั้งในกรณีที่จำเป็นเท่านั้น ตามมติของที่ประชุมคณะกรรมการในวันที่ 29 พฤศจิกายน 2537 เพื่อทำหน้าที่ทบทวนและวิจารณ์ร่างข้อกำหนดของคณะอนุกรรมการเทคนิค ก่อนส่งต่อไปยังคณะกรรมการฯ เพื่อประกอบการพิจารณาอนุมัติ ประกอบด้วยผู้ทรงคุณวุฒิ ผู้เชี่ยวชาญและกลุ่มผู้สนใจทั่วไป
ฝ่ายเลขานุการจะเป็นผู้จัดเตรียมการประชุม
