ลุ่มน้ำทะเลสาบสงขลาเป็นพื้นที่ที่ระบบนิเวศมีความหลากหลายทางชีวภาพ
มีลำน้ำสาขาน้อยใหญ่ที่ไหลลงทะเลสาบและเป็นพื้นที่เหมาะสมต่อการตั้งถิ่นฐาน การเกษตรกรรม รวมถึงอุตสาหกรรม
คลองที่ไหลลงสู่ทะเลสาบโดยตรงได้แก่ คลองระโนด คลงป่าพะยอม คลองท่าแมะ คลองท่าเชียด คลองตะโหมด คลองป่าบอน
คลองพรุพ้อ คลองรัตภูมิ คลองอู่ตะเภา คลองสำโรง คลองพะวง และคลองขา
| จุดที่ |
ปริมาณความสกปรก (กก./วัน) |
| 1. ปากคลองโรง |
766.64 |
| 2. ปากคลองระโนด |
530.7 |
| 3. ปากคลองตะเครียะ |
922.95 |
| 4. ชุมชนทะเลน้อย |
- |
| 5. คลองท่าแนะ (ปากคลองปากประ) |
17,231.37 |
| 6. ปากคลองลำปำ |
17,174.08 |
| 7. ปากคลองท่าเชียด (ปากคลองบางแก้ว) |
8,750.73 |
| 8. ปากคลองป่าบอน |
468.49 |
| 9. ปากคลองปากบน |
254.15 |
| 10. ปากคลองพรุพ้อ |
294.82 |
| 11. ปากคลองรัตภูมิ (คลองภูมี) |
1,530.661 |
| 12. ปากคลองบางกล่ำ |
11,241.33 |
| 13. ปากคลองอู่ตะเภา |
23,776.62 |
| 14. ปากคลองบางโหนด |
4,717.57 |
| 15. ปากคลองพะวง |
1,333.70 |
| 16. ปากคลองสำโรง |
876.35 |
| 17. ปากคลองขววาาง |
139.33 |
| รวม |
90,009.44 |
ที่มา : กระทรวงทรัพยากรธรรมชาติและสิ่งแวดล้อม, 2546
|